MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sediminis HAW-EB3 chromosome

Total Repeats: 97847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009831	AAATT	2	10	4	13	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009831	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009831	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009831	CTTT	2	8	114	121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009831	TTG	2	6	125	130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009831	AT	3	6	131	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009831	T	6	6	257	262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009831	GAT	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009831	ATTT	2	8	354	361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009831	AGCGC	2	10	450	459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009831	ATC	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373142
12	NC_009831	ATC	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373142
13	NC_009831	TGG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
14	NC_009831	CGT	2	6	717	722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373142
15	NC_009831	TGC	2	6	774	779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373142
16	NC_009831	CTC	2	6	785	790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157373142
17	NC_009831	GGT	3	9	962	970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
18	NC_009831	CGG	2	6	997	1002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373142
19	NC_009831	CACG	2	8	1017	1024	25 %	0 %	25 %	50 %	157373142
20	NC_009831	GTG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
21	NC_009831	AGG	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373142
22	NC_009831	CAC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373142
23	NC_009831	CTTG	2	8	1258	1265	0 %	50 %	25 %	25 %	157373142
24	NC_009831	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373142
25	NC_009831	AG	3	6	1331	1336	50 %	0 %	50 %	0 %	157373142
26	NC_009831	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373142
27	NC_009831	TGG	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373142
28	NC_009831	GCC	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373142
29	NC_009831	GATC	2	8	1705	1712	25 %	25 %	25 %	25 %	157373142
30	NC_009831	CTTCAC	2	12	1714	1725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	157373142
31	NC_009831	CAC	3	9	1831	1839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373142
32	NC_009831	TGT	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373142
33	NC_009831	TA	3	6	1933	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009831	A	6	6	1943	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009831	TTC	2	6	2010	2015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
36	NC_009831	TCT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
37	NC_009831	GAA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373143
38	NC_009831	TAC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
39	NC_009831	CAT	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
40	NC_009831	TCG	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
41	NC_009831	TCT	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
42	NC_009831	CAG	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373143
43	NC_009831	CTTTCT	2	12	2377	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
44	NC_009831	CAT	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
45	NC_009831	TCT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
46	NC_009831	TCA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
47	NC_009831	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373143
48	NC_009831	GAA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373143
49	NC_009831	ACC	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
50	NC_009831	CTT	2	6	2680	2685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373143
51	NC_009831	CAT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
52	NC_009831	CAC	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
53	NC_009831	AAT	2	6	2804	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373143
54	NC_009831	TGG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373143
55	NC_009831	AGT	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
56	NC_009831	ACC	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
57	NC_009831	ATC	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
58	NC_009831	CAC	2	6	2962	2967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
59	NC_009831	CAT	3	9	2978	2986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373143
60	NC_009831	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
61	NC_009831	TGT	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373143
62	NC_009831	GCT	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373143
63	NC_009831	CAC	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157373143
64	NC_009831	TGA	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
65	NC_009831	CAA	2	6	3436	3441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157373143
66	NC_009831	CAG	3	9	3442	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373143
67	NC_009831	TGA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373143
68	NC_009831	AT	3	6	3610	3615	50 %	50 %	0 %	0 %	157373143
69	NC_009831	TATT	2	8	3636	3643	25 %	75 %	0 %	0 %	157373144
70	NC_009831	T	7	7	3653	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	157373144
71	NC_009831	G	6	6	3660	3665	0 %	0 %	100 %	0 %	157373144
72	NC_009831	TGC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373144
73	NC_009831	TTA	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373144
74	NC_009831	TGA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373144
75	NC_009831	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157373145
76	NC_009831	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373145
77	NC_009831	CTTT	2	8	4041	4048	0 %	75 %	0 %	25 %	157373145
78	NC_009831	TGT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373145
79	NC_009831	GAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373145
80	NC_009831	ACG	3	9	4260	4268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373146
81	NC_009831	ACGCTT	2	12	4323	4334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157373146
82	NC_009831	GTTA	2	8	4387	4394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009831	A	6	6	4429	4434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009831	CAA	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009831	AATT	2	8	4505	4512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009831	GATC	2	8	4621	4628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009831	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009831	AAT	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009831	GAT	2	6	4715	4720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009831	TAT	2	6	4738	4743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009831	ATC	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009831	CT	3	6	4780	4785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009831	TG	3	6	4787	4792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009831	GCA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373147
95	NC_009831	GAC	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373147
96	NC_009831	CT	3	6	4860	4865	0 %	50 %	0 %	50 %	157373147
97	NC_009831	ATGG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	50 %	0 %	157373147
98	NC_009831	ACATCA	2	12	4975	4986	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157373147
99	NC_009831	T	6	6	4995	5000	0 %	100 %	0 %	0 %	157373147
100	NC_009831	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373147
101	NC_009831	GGC	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157373147
102	NC_009831	CTT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373147
103	NC_009831	TGG	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373147
104	NC_009831	GAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
105	NC_009831	TAC	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
106	NC_009831	TTTA	2	8	5489	5496	25 %	75 %	0 %	0 %	157373147
107	NC_009831	GAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373147
108	NC_009831	GAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
109	NC_009831	ATC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
110	NC_009831	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157373147
111	NC_009831	AGAC	2	8	5633	5640	50 %	0 %	25 %	25 %	157373147
112	NC_009831	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157373147
113	NC_009831	CTT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157373147
114	NC_009831	CAAGAT	2	12	5957	5968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157373147
115	NC_009831	CGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373147
116	NC_009831	AACC	2	8	6047	6054	50 %	0 %	0 %	50 %	157373147
117	NC_009831	TGG	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373147
118	NC_009831	GA	3	6	6137	6142	50 %	0 %	50 %	0 %	157373147
119	NC_009831	AGA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373147
120	NC_009831	TGA	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157373148
121	NC_009831	GA	3	6	6283	6288	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
122	NC_009831	AGTG	2	8	6327	6334	25 %	25 %	50 %	0 %	157373148
123	NC_009831	TCAC	2	8	6336	6343	25 %	25 %	0 %	50 %	157373148
124	NC_009831	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157373148
125	NC_009831	AGGA	2	8	6410	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	157373148
126	NC_009831	A	6	6	6436	6441	100 %	0 %	0 %	0 %	157373148
127	NC_009831	GAA	2	6	6559	6564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
128	NC_009831	TTA	2	6	6675	6680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157373148
129	NC_009831	TGT	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157373148
130	NC_009831	TGC	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373148
131	NC_009831	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
132	NC_009831	CTATCG	2	12	6863	6874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157373148
133	NC_009831	CGA	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157373148
134	NC_009831	CGT	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157373148
135	NC_009831	AAT	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373148
136	NC_009831	AAT	2	6	7102	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157373148
137	NC_009831	GAA	2	6	7117	7122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157373148
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142	NC_009831	CA	3	6	7336	7341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009831	T	7	7	7368	7374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_009831	TCT	2	6	7505	7510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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